В гугле много мануалов как поставить на мак ffmpeg.
ffmpeg -i /patch/to/ifile -acodec copy -vcodec copy -ss HH:MM:SS -t HH:MM:SS /patch/to/ofile
ss - пропустить часов:минут:секунд
t - записать часов:минут:секунд
т.е. ffmpeg -i /patch/to/ifile -acodec copy -vcodec copy -ss 00:00:30 -t 00:01:30 /patch/to/ofile - пропустит 30секунд от начала(в данном случае) и копирует(в данном случае) полторы минуты в ofile.
Если много дорожек, то используем -map.
Кий, да будет вам известно, что дуб - говно и ничего, кроме хвидов, двихсов, не воспринимает.